Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
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ERV3-1Q14264 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
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ERV3-1Q14264 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
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ERV3-1Q14264 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
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ERV3-1Q14264 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
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ERV3-1Q14264 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
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ERV3-1Q14264 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
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