Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SPIDRQ14159 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SPIDRQ14159 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SPIDRQ14159 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SPIDRQ14159 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SPIDRQ14159 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SPIDRQ14159 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SPIDRQ14159 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SPIDRQ14159 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SPIDRQ14159 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SPIDRQ14159 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SPIDRQ14159 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SPIDRQ14159 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SPIDRQ14159 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SPIDRQ14159 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SPIDRQ14159 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SPIDRQ14159 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SPIDRQ14159 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SPIDRQ14159 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SPIDRQ14159 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SPIDRQ14159 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SPIDRQ14159 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SPIDRQ14159 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SPIDRQ14159 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SPIDRQ14159 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SPIDRQ14159 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SPIDRQ14159 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SPIDRQ14159 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SPIDRQ14159 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SPIDRQ14159 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SPIDRQ14159 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SPIDRQ14159 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SPIDRQ14159 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SPIDRQ14159 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SPIDRQ14159 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SPIDRQ14159 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SPIDRQ14159 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SPIDRQ14159 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SPIDRQ14159 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SPIDRQ14159 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SPIDRQ14159 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SPIDRQ14159 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SPIDRQ14159 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SPIDRQ14159 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SPIDRQ14159 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SPIDRQ14159 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SPIDRQ14159 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SPIDRQ14159 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SPIDRQ14159 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SPIDRQ14159 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SPIDRQ14159 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SPIDRQ14159 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SPIDRQ14159 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SPIDRQ14159 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SPIDRQ14159 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
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SPIDRQ14159 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
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SPIDRQ14159 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SPIDRQ14159 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
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SPIDRQ14159 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
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SPIDRQ14159 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SPIDRQ14159 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
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SPIDRQ14159 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SPIDRQ14159 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SPIDRQ14159 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SPIDRQ14159 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SPIDRQ14159 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SPIDRQ14159 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SPIDRQ14159 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SPIDRQ14159 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SPIDRQ14159 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SPIDRQ14159 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SPIDRQ14159 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SPIDRQ14159 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
SPIDRQ14159 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
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