Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 METTL21EP-202ENST00000605100 2312 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
COL9A3Q14050 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.3 ms