Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SPTAN1Q13813 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SPTAN1Q13813 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SPTAN1Q13813 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SPTAN1Q13813 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SPTAN1Q13813 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SPTAN1Q13813 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SPTAN1Q13813 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SPTAN1Q13813 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
SPTAN1Q13813 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SPTAN1Q13813 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SPTAN1Q13813 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
SPTAN1Q13813 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
SPTAN1Q13813 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SPTAN1Q13813 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SPTAN1Q13813 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SPTAN1Q13813 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SPTAN1Q13813 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
SPTAN1Q13813 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
SPTAN1Q13813 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SPTAN1Q13813 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SPTAN1Q13813 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SPTAN1Q13813 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SPTAN1Q13813 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
SPTAN1Q13813 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
SPTAN1Q13813 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SPTAN1Q13813 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SPTAN1Q13813 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SPTAN1Q13813 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SPTAN1Q13813 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SPTAN1Q13813 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SPTAN1Q13813 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SPTAN1Q13813 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
SPTAN1Q13813 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SPTAN1Q13813 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SPTAN1Q13813 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SPTAN1Q13813 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SPTAN1Q13813 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SPTAN1Q13813 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SPTAN1Q13813 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SPTAN1Q13813 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
SPTAN1Q13813 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
SPTAN1Q13813 AC097634.1-201ENST00000604491 2467 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SPTAN1Q13813 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SPTAN1Q13813 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SPTAN1Q13813 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SPTAN1Q13813 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SPTAN1Q13813 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SPTAN1Q13813 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SPTAN1Q13813 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SPTAN1Q13813 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SPTAN1Q13813 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SPTAN1Q13813 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
SPTAN1Q13813 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 AC010480.1-201ENST00000624823 684 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 LINC01862-201ENST00000593792 478 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
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