Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NME3Q13232 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NME3Q13232 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NME3Q13232 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NME3Q13232 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NME3Q13232 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
NME3Q13232 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
NME3Q13232 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NME3Q13232 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
NME3Q13232 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NME3Q13232 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NME3Q13232 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NME3Q13232 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NME3Q13232 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NME3Q13232 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NME3Q13232 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NME3Q13232 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NME3Q13232 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NME3Q13232 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NME3Q13232 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NME3Q13232 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NME3Q13232 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NME3Q13232 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NME3Q13232 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NME3Q13232 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NME3Q13232 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NME3Q13232 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NME3Q13232 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NME3Q13232 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NME3Q13232 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
NME3Q13232 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
NME3Q13232 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NME3Q13232 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NME3Q13232 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NME3Q13232 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NME3Q13232 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NME3Q13232 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NME3Q13232 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NME3Q13232 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NME3Q13232 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NME3Q13232 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NME3Q13232 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NME3Q13232 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NME3Q13232 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NME3Q13232 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NME3Q13232 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NME3Q13232 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NME3Q13232 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NME3Q13232 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NME3Q13232 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NME3Q13232 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NME3Q13232 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NME3Q13232 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NME3Q13232 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NME3Q13232 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NME3Q13232 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NME3Q13232 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NME3Q13232 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NME3Q13232 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
NME3Q13232 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NME3Q13232 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NME3Q13232 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NME3Q13232 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.2 ms