Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
TRDNQ13061 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.1 ms