Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
KCNMA1Q12791 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms