Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 KIAA0100-201ENST00000389003 6852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 DOCK8-205ENST00000453981 7237 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 CPNE4-208ENST00000511604 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 NPIPB5-209ENST00000517539 3569 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 SORBS1-210ENST00000371246 6931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 BRPF3-212ENST00000534694 4628 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 STAMBP-201ENST00000339566 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 CTC1-201ENST00000315684 7021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 RPS6KA6-201ENST00000262752 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 SLC23A2-202ENST00000379333 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 CCR6-202ENST00000349984 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 AC023055.1-201ENST00000546837 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 FTLP17-201ENST00000432567 525 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 TNR-IT1-201ENST00000455447 630 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 MRPS5P4-201ENST00000592830 325 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 PCBP1-AS1-322ENST00000628147 553 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 ORC3-206ENST00000546266 2470 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 FMN1-211ENST00000561249 4251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 OR2B11-203ENST00000641527 4545 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 STRADA-233ENST00000638888 1718 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 NPIPB13-201ENST00000520915 3584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 AMPD3-209ENST00000529507 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 NUP210L-202ENST00000368553 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 RSU1-205ENST00000602389 3639 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 NMD3-201ENST00000351193 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 EIF4G2-205ENST00000525681 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 GPM6B-201ENST00000316715 3275 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 PRKCQ-204ENST00000610727 3077 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 SSR3-201ENST00000265044 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 SH3PXD2A-202ENST00000355946 11245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 PHYHIPL-202ENST00000373880 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 ZNF468-201ENST00000243639 4027 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 TP53BP1-203ENST00000382044 10384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 AC114401.1-201ENST00000484222 2084 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 ADA2-202ENST00000330232 3195 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 HMGB4-203ENST00000519684 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 KCNMA1-273ENST00000639913 12071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 CTAGE5-205ENST00000348007 2762 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 AFG1L-201ENST00000368977 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 AP4S1-211ENST00000616371 4595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 OIP5-AS1-201ENST00000500949 8829 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 NDUFA4-201ENST00000339600 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 SPATA31D1-201ENST00000344803 4833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 MPEG1-201ENST00000361050 4442 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 SATL1-201ENST00000395409 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 ZNF716-201ENST00000420713 5197 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 ZNF521-203ENST00000538137 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 RN7SKP48-201ENST00000365031 328 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 SNORA57.2-201ENST00000391265 128 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 AL049758.1-201ENST00000423154 397 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 AC096922.1-201ENST00000461635 651 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 RPL23AP77-201ENST00000588044 463 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 CTNND1-221ENST00000529873 5931 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 ZNF585A-202ENST00000356958 6822 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 AC026124.1-201ENST00000545709 3457 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 AIMP1-203ENST00000442366 2519 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 COLGALT2-203ENST00000367521 4723 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 CECR2-206ENST00000612582 9645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 VN1R1-201ENST00000321039 2353 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD11P31277 ZNF462-204ENST00000441147 4691 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
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