Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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PTPRBP23467 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRBP23467 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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PTPRBP23467 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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PTPRBP23467 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
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PTPRBP23467 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRBP23467 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRBP23467 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRBP23467 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRBP23467 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRBP23467 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRBP23467 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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PTPRBP23467 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRBP23467 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRBP23467 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRBP23467 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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