Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCN11A-201ENST00000302328 6500 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 PART1-203ENST00000515734 2569 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 ASPH-230ENST00000541428 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 MROH3P-202ENST00000635940 2556 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC110597.1-201ENST00000562669 3176 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC016251.1-201ENST00000624299 4198 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 UTY-203ENST00000362096 4990 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 PAN2-202ENST00000425394 5372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 DOCK3-201ENST00000266037 8755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF469-201ENST00000437464 13203 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 LHX9-203ENST00000367390 7413 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 EPHA1-AS1-202ENST00000429289 5018 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNM1L-202ENST00000358214 3229 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC097478.1-207ENST00000612706 2422 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAP2-203ENST00000361559 2038 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCARB2-211ENST00000638603 4284 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF334-201ENST00000347606 3890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 KAT14-201ENST00000377681 3483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 TLR10-204ENST00000506111 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 EPS15L1-214ENST00000602009 3915 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 FMOD-201ENST00000354955 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF195-203ENST00000343338 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 ST6GAL2-201ENST00000361686 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCDH15-226ENST00000613657 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD160-205ENST00000616463 3388 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 TTI1-201ENST00000373447 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 USP16-203ENST00000399975 2960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
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KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC066616.1-201ENST00000486795 413 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092674.1-201ENST00000513871 571 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
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KRTAP9-3Q9BYQ3 CEBPG-202ENST00000585933 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
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KRTAP9-3Q9BYQ3 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
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KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01630-208ENST00000635680 4363 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 CSNK1G1-201ENST00000303052 8179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZMYND8-207ENST00000396281 5511 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACKR2-202ENST00000442925 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTPDC1-204ENST00000620992 4437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 KIRREL1-203ENST00000368172 6870 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADAL-202ENST00000422466 3767 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAPK10-392ENST00000642103 3126 ntAPPRIS P2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 BTBD3-202ENST00000378226 4904 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 NFAT5-208ENST00000566899 4914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 MYOM1-202ENST00000356443 5847 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 CTNND1-206ENST00000415361 5832 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 CTNND1-225ENST00000530094 5814 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAT4-201ENST00000335110 9669 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 OSBPL9-202ENST00000371714 3352 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 IST1-208ENST00000535424 4082 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 INTS4-209ENST00000534064 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 ERG-204ENST00000398907 4809 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-3Q9BYQ3 CREB3L2-207ENST00000616381 7133 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
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