Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AC084036.1-201ENST00000609190 508 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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RTL8BQ17RB0 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
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RTL8BQ17RB0 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
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RTL8BQ17RB0 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
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RTL8BQ17RB0 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
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RTL8BQ17RB0 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
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RTL8BQ17RB0 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
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