Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
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CCDC6Q16204 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
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CCDC6Q16204 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
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CCDC6Q16204 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
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CCDC6Q16204 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
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CCDC6Q16204 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.77
CCDC6Q16204 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
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