Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 KNL1-201ENST00000346991 9573 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 OR5M3-201ENST00000312240 1051 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC1.53□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
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