Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIN2BQ13224 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIN2BQ13224 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIN2BQ13224 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIN2BQ13224 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIN2BQ13224 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIN2BQ13224 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIN2BQ13224 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIN2BQ13224 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIN2BQ13224 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIN2BQ13224 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIN2BQ13224 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 AC105036.1-201ENST00000566222 271 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 AC104781.1-201ENST00000449838 397 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GRIN2BQ13224 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
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