Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 ABI1-207ENST00000376142 3576 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 FGF10-201ENST00000264664 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 FOXJ3-203ENST00000372571 4468 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 UNC13B-210ENST00000636694 8012 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 ANK2-215ENST00000509550 3638 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 STK4-207ENST00000499879 6161 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 AC241584.2-201ENST00000637142 2090 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 PLCH1-203ENST00000447496 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 TRIM6-TRIM34-201ENST00000354852 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 CPS1-203ENST00000430249 5698 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 RNA5SP65-201ENST00000363166 119 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 AL359092.1-201ENST00000417156 265 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 ZNF562-202ENST00000453372 2111 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 NXF2B-203ENST00000604395 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 NXF2-201ENST00000604790 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 ESRRG-201ENST00000359162 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 SMAD1-202ENST00000394092 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 FSTL5-202ENST00000379164 4757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 NLRP4-203ENST00000587891 3201 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 CYP2C8-212ENST00000623108 1962 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 SGK3-201ENST00000345714 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 PTK2-228ENST00000521059 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 TPRX1P1-201ENST00000557620 319 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 PFKM-232ENST00000629846 381 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 AP2B1-215ENST00000616681 3267 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 AC009237.3-203ENST00000442128 3551 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 GRIK2-205ENST00000369138 4921 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 PYHIN1-203ENST00000368140 2083 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 SYNE2-216ENST00000555002 11532 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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