Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
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CSTF3Q12996 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
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CSTF3Q12996 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CSTF3Q12996 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
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