Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 SUN1-202ENST00000389574 3812 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 TNNT3-208ENST00000397301 818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 MED15P4-201ENST00000417579 393 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL161447.1-201ENST00000427811 230 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATP6V1G1P3-201ENST00000442568 280 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL356121.1-201ENST00000442911 156 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC064862.2-201ENST00000445460 196 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC073626.2-201ENST00000449443 316 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC005020.1-201ENST00000455459 526 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SL535P-201ENST00000479087 296 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC105265.1-201ENST00000479379 179 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 IGHVII-1-1-201ENST00000517907 180 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC120036.4-201ENST00000521874 256 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL096869.1-201ENST00000557622 559 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC027688.1-201ENST00000568471 584 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL031722.1-201ENST00000570247 220 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC087164.1-201ENST00000577847 513 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC009502.1-202ENST00000606673 602 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 U3.50-201ENST00000611947 228 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 Metazoa_SRP.159-201ENST00000612585 265 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC138894.4-201ENST00000616703 256 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR6831-201ENST00000617240 81 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC139491.2-201ENST00000515403 3632 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 OSBPL6-204ENST00000359685 7114 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 OTX2-201ENST00000339475 3001 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 UTY-203ENST00000362096 4990 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 PPP6R3-202ENST00000265637 4783 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 BRS3-201ENST00000370648 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 GIGYF2-203ENST00000409451 5937 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 ANAPC5-218ENST00000541887 2400 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 NUMA1-201ENST00000351960 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL445933.1-201ENST00000434240 2242 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 ANKRD20A5P-201ENST00000431648 3556 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 ANO7-201ENST00000274979 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC34A2-201ENST00000382051 4122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 SHPRH-206ENST00000438092 6994 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC239859.1-201ENST00000449715 2594 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 ARFIP1-201ENST00000353617 3111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 PIWIL3-205ENST00000616349 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 SMG7-201ENST00000347615 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 VWA5B1-202ENST00000375079 3859 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00838-201ENST00000562956 2936 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC25A30-204ENST00000519676 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 DIAPH2-201ENST00000324765 9333 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 SFXN2-201ENST00000369893 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 NEK1-207ENST00000511633 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 SETD5-201ENST00000302463 4786 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPS10-NUDT3-202ENST00000639725 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01310-201ENST00000380981 4015 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 KCNH6-205ENST00000583023 3821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 MOBP-202ENST00000383754 3051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 SEMA4D-208ENST00000422704 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 CDC42BPA-205ENST00000366769 10855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 UNC119-205ENST00000484980 4189 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 MRS2-204ENST00000443868 3980 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 RBM17-205ENST00000446108 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 CC2D2A-202ENST00000424120 5249 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 YME1L1-209ENST00000613434 4127 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 NUTM1-202ENST00000438749 3922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF304-203ENST00000443917 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMEM108-211ENST00000515826 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 NLRC5-201ENST00000262510 6822 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNIP1-201ENST00000296215 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNHIT6-202ENST00000431532 6080 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 SEMA4G-201ENST00000210633 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 CSF2RB-201ENST00000262825 4087 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 FMN1-203ENST00000558197 4060 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 NUP210L-203ENST00000368559 5889 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 HPCAL4-202ENST00000612703 4436 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF442-201ENST00000242804 6219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 LNX1-201ENST00000263925 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 FRMD6-201ENST00000344768 2972 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 ITGAE-201ENST00000263087 3858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 KIF18B-202ENST00000587309 4217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMEM169-201ENST00000295658 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 RBM23-204ENST00000399922 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.8 ms