Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COL24A1Q17RW2 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 AC016542.2-201ENST00000624201 619 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
COL24A1Q17RW2 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.6 ms