Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 AC009303.3-201ENST00000591103 736 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
IMPG1Q17R60 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms