Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TAF1AQ15573 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.2 ms