Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
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