Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
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