Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
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