Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
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CSTF3Q12996 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
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CSTF3Q12996 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
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CSTF3Q12996 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
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CSTF3Q12996 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
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CSTF3Q12996 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
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CSTF3Q12996 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
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CSTF3Q12996 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
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CSTF3Q12996 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CSTF3Q12996 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
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