Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
RBBP4Q09028 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.5 ms