Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPREP23469 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPREP23469 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPREP23469 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPREP23469 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPREP23469 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPREP23469 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPREP23469 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPREP23469 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPREP23469 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPREP23469 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPREP23469 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPREP23469 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPREP23469 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPREP23469 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPREP23469 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPREP23469 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPREP23469 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPREP23469 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPREP23469 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPREP23469 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPREP23469 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPREP23469 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPREP23469 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPREP23469 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPREP23469 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPREP23469 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPREP23469 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPREP23469 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPREP23469 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPREP23469 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPREP23469 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPREP23469 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPREP23469 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPREP23469 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPREP23469 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPREP23469 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
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PTPREP23469 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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PTPREP23469 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPREP23469 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPREP23469 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
PTPREP23469 FRMD4B-210ENST00000478263 3761 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
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PTPREP23469 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPREP23469 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPREP23469 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPREP23469 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPREP23469 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPREP23469 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPREP23469 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPREP23469 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPREP23469 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPREP23469 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPREP23469 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPREP23469 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPREP23469 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPREP23469 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPREP23469 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPREP23469 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
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