Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 KIF14-202ENST00000614960 6838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMG1Q96Q15 AC009137.2-201ENST00000568179 641 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
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