Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
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