Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
DDB1Q16531 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
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