Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USF2Q15853 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
USF2Q15853 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USF2Q15853 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USF2Q15853 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USF2Q15853 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
USF2Q15853 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
USF2Q15853 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
USF2Q15853 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
USF2Q15853 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
USF2Q15853 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
USF2Q15853 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
USF2Q15853 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
USF2Q15853 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USF2Q15853 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USF2Q15853 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
USF2Q15853 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
USF2Q15853 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
USF2Q15853 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USF2Q15853 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
USF2Q15853 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
USF2Q15853 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USF2Q15853 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USF2Q15853 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
USF2Q15853 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USF2Q15853 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USF2Q15853 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USF2Q15853 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USF2Q15853 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USF2Q15853 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
USF2Q15853 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
USF2Q15853 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USF2Q15853 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
USF2Q15853 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
USF2Q15853 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
USF2Q15853 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
USF2Q15853 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
USF2Q15853 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
USF2Q15853 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
USF2Q15853 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USF2Q15853 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
USF2Q15853 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USF2Q15853 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USF2Q15853 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
USF2Q15853 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
USF2Q15853 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USF2Q15853 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USF2Q15853 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
USF2Q15853 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USF2Q15853 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
USF2Q15853 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
USF2Q15853 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
USF2Q15853 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USF2Q15853 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USF2Q15853 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USF2Q15853 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC105460.2-202ENST00000502936 825 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
USF2Q15853 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USF2Q15853 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USF2Q15853 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
USF2Q15853 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
USF2Q15853 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
USF2Q15853 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USF2Q15853 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USF2Q15853 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
USF2Q15853 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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