Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.8 ms