Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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TOP3AQ13472 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC012668.2-201ENST00000431727 503 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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TOP3AQ13472 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
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TOP3AQ13472 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
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TOP3AQ13472 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
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