Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
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HOXD10P28358 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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HOXD10P28358 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
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HOXD10P28358 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
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HOXD10P28358 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
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HOXD10P28358 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
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HOXD10P28358 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
HOXD10P28358 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.81
HOXD10P28358 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
HOXD10P28358 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
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