Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
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PTPRAP18433 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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PTPRAP18433 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
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PTPRAP18433 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
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PTPRAP18433 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
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PTPRAP18433 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
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PTPRAP18433 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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