Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 TTTY2B-201ENST00000450591 3168 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AC079061.1-201ENST00000499579 3075 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 PIGG-208ENST00000504346 3019 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF530-201ENST00000332854 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 PPP1R18-202ENST00000399199 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 OTOA-203ENST00000388957 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CASP7-204ENST00000369321 2620 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 KRT78-202ENST00000359499 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF765-206ENST00000594030 7588 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 FBLN5-201ENST00000267620 2423 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 MSS51-201ENST00000299432 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 WDR36-203ENST00000506538 7048 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ALPL-203ENST00000374832 2193 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM107A-204ENST00000464064 2159 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 LOXHD1-207ENST00000441551 6226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CPNE4-209ENST00000512055 5431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CYP4A22-201ENST00000294337 1725 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CACUL1-201ENST00000369151 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 EREG-201ENST00000244869 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 DTL-201ENST00000366991 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 USP6NL-201ENST00000277575 4512 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SVIP-201ENST00000354193 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ATL3-201ENST00000398868 7135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 TRERF1-202ENST00000354325 4138 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 RASGEF1A-203ENST00000395809 4104 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM90A20P-201ENST00000528221 1395 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SETD5-204ENST00000406341 6582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CD300A-203ENST00000361933 382 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA73A-201ENST00000364938 206 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ACOT11-202ENST00000371316 6369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR596-201ENST00000385091 77 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 MRPS16P2-201ENST00000445106 408 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 GFOD1-AS1-201ENST00000446001 332 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AL355483.1-201ENST00000450469 237 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL401P-201ENST00000470065 298 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AP003551.1-201ENST00000495884 574 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP411-201ENST00000516136 114 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CSRP1-209ENST00000526723 574 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AL121988.1-201ENST00000542839 560 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AC073571.1-201ENST00000549103 475 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AL049873.2-201ENST00000555790 498 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AL023803.1-201ENST00000570096 187 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL36-205ENST00000579649 449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR4664-201ENST00000583819 71 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 FXYD6P1-201ENST00000604857 285 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 IGKV2OR2-10-201ENST00000613976 311 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 Metazoa_SRP.120-201ENST00000614195 252 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AC145285.8-201ENST00000619561 255 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR8083-201ENST00000620823 89 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00282-201ENST00000626362 654 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AL603764.2-201ENST00000636038 344 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF146-202ENST00000456324 3780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 INVS-202ENST00000262457 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SNTN-203ENST00000496807 3746 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CASP8AP2-205ENST00000551025 6151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 DAB2-202ENST00000339788 3690 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 FBF1-212ENST00000636174 3626 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AC005481.1-201ENST00000409610 3456 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ATG16L1-203ENST00000392017 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF19-201ENST00000288177 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 GJA5-202ENST00000579774 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 RPGR-201ENST00000318842 3108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 NASP-224ENST00000537798 3097 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 NOTCH2NL-203ENST00000578207 5042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 VPS8-227ENST00000625842 4969 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 OGDH-203ENST00000439616 2962 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ITGAX-201ENST00000268296 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ALS2CL-201ENST00000318962 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 FN1-212ENST00000446046 7952 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 PARP11-204ENST00000447133 4377 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.3 ms