Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms