Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

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Length 389 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 CYP3A5-203ENST00000439761 1075 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 AC244131.2-201ENST00000612592 512 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
ANKRD42Q8N9B4 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
ANKRD42Q8N9B4 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
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