Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
IMPG1Q17R60 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms