Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 AL162233.1-201ENST00000620014 944 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC1.76□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 BCL2A1-201ENST00000267953 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC1.75□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC1.75□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
RYR3Q15413 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
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