Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms