Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GTF2H3Q13889 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms