Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B0

CTDP1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1Q9Y5B0 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDP1Q9Y5B0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDP1Q9Y5B0 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDP1Q9Y5B0 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDP1Q9Y5B0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDP1Q9Y5B0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDP1Q9Y5B0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDP1Q9Y5B0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDP1Q9Y5B0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDP1Q9Y5B0 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDP1Q9Y5B0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDP1Q9Y5B0 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDP1Q9Y5B0 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDP1Q9Y5B0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDP1Q9Y5B0 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDP1Q9Y5B0 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDP1Q9Y5B0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDP1Q9Y5B0 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDP1Q9Y5B0 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDP1Q9Y5B0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDP1Q9Y5B0 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDP1Q9Y5B0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDP1Q9Y5B0 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDP1Q9Y5B0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDP1Q9Y5B0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDP1Q9Y5B0 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDP1Q9Y5B0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDP1Q9Y5B0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDP1Q9Y5B0 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDP1Q9Y5B0 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDP1Q9Y5B0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDP1Q9Y5B0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDP1Q9Y5B0 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDP1Q9Y5B0 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDP1Q9Y5B0 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDP1Q9Y5B0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDP1Q9Y5B0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CTDP1Q9Y5B0 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CTDP1Q9Y5B0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDP1Q9Y5B0 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDP1Q9Y5B0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDP1Q9Y5B0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDP1Q9Y5B0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDP1Q9Y5B0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDP1Q9Y5B0 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDP1Q9Y5B0 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDP1Q9Y5B0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDP1Q9Y5B0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDP1Q9Y5B0 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDP1Q9Y5B0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDP1Q9Y5B0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDP1Q9Y5B0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDP1Q9Y5B0 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDP1Q9Y5B0 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDP1Q9Y5B0 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDP1Q9Y5B0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDP1Q9Y5B0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDP1Q9Y5B0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDP1Q9Y5B0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDP1Q9Y5B0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDP1Q9Y5B0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDP1Q9Y5B0 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDP1Q9Y5B0 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDP1Q9Y5B0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDP1Q9Y5B0 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDP1Q9Y5B0 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDP1Q9Y5B0 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDP1Q9Y5B0 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDP1Q9Y5B0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDP1Q9Y5B0 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDP1Q9Y5B0 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDP1Q9Y5B0 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDP1Q9Y5B0 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDP1Q9Y5B0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDP1Q9Y5B0 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDP1Q9Y5B0 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDP1Q9Y5B0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDP1Q9Y5B0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDP1Q9Y5B0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDP1Q9Y5B0 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDP1Q9Y5B0 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDP1Q9Y5B0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDP1Q9Y5B0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDP1Q9Y5B0 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDP1Q9Y5B0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDP1Q9Y5B0 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDP1Q9Y5B0 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDP1Q9Y5B0 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDP1Q9Y5B0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDP1Q9Y5B0 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDP1Q9Y5B0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDP1Q9Y5B0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDP1Q9Y5B0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDP1Q9Y5B0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDP1Q9Y5B0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTDP1Q9Y5B0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTDP1Q9Y5B0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTDP1Q9Y5B0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTDP1Q9Y5B0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTDP1Q9Y5B0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms