Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AFG3L2Q9Y4W6 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms