Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF330Q9Y3S2 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF330Q9Y3S2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF330Q9Y3S2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF330Q9Y3S2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF330Q9Y3S2 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF330Q9Y3S2 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF330Q9Y3S2 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF330Q9Y3S2 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF330Q9Y3S2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF330Q9Y3S2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF330Q9Y3S2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF330Q9Y3S2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF330Q9Y3S2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF330Q9Y3S2 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF330Q9Y3S2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF330Q9Y3S2 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF330Q9Y3S2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF330Q9Y3S2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF330Q9Y3S2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF330Q9Y3S2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF330Q9Y3S2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF330Q9Y3S2 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF330Q9Y3S2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF330Q9Y3S2 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF330Q9Y3S2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF330Q9Y3S2 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF330Q9Y3S2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF330Q9Y3S2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF330Q9Y3S2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF330Q9Y3S2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF330Q9Y3S2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF330Q9Y3S2 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF330Q9Y3S2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF330Q9Y3S2 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF330Q9Y3S2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF330Q9Y3S2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF330Q9Y3S2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF330Q9Y3S2 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF330Q9Y3S2 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF330Q9Y3S2 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF330Q9Y3S2 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF330Q9Y3S2 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF330Q9Y3S2 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF330Q9Y3S2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF330Q9Y3S2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF330Q9Y3S2 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF330Q9Y3S2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms