Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U8

LEMD3, Inner nuclear membrane protein Man1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD3Q9Y2U8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LEMD3Q9Y2U8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LEMD3Q9Y2U8 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LEMD3Q9Y2U8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LEMD3Q9Y2U8 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LEMD3Q9Y2U8 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LEMD3Q9Y2U8 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LEMD3Q9Y2U8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LEMD3Q9Y2U8 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LEMD3Q9Y2U8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LEMD3Q9Y2U8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LEMD3Q9Y2U8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LEMD3Q9Y2U8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LEMD3Q9Y2U8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LEMD3Q9Y2U8 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LEMD3Q9Y2U8 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LEMD3Q9Y2U8 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LEMD3Q9Y2U8 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LEMD3Q9Y2U8 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LEMD3Q9Y2U8 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms