Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVW-1Q9UQF0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms