Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM35Q9UPQ4 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms