Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FZD4Q9ULV1 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
FZD4Q9ULV1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
FZD4Q9ULV1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms