Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PALD1Q9ULE6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms