Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms